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國家信息農(nóng)業(yè)工程技術(shù)中心學(xué)術(shù)報告
報告題目:基于機(jī)器學(xué)習(xí)和計算機(jī)視覺的多尺度作物表型組研究及其在稻麥育種中的應(yīng)用/Combining machine learning and computer vision to establish novel multi-scale crop phenomics methods and their applications in rice and wheat breeding
報告人:周濟(jì) 教授
報告人單位:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)作物表型組學(xué)學(xué)交叉研究中心
報告時間:9月1日(周日)14:00
報告地點:生科樓A5002
內(nèi)容摘要:
機(jī)器學(xué)習(xí)、計算機(jī)視覺、高通量數(shù)據(jù)分析等技術(shù)與生命科學(xué)的交叉結(jié)合正逐漸為植物研究開辟一系列全新的研究方向。通過學(xué)科交叉的方法可以基于多元數(shù)據(jù)集動態(tài)生成非常復(fù)雜的規(guī)則,從而完成對生物大數(shù)據(jù)的分類和復(fù)雜趨勢的預(yù)測,進(jìn)而建立強(qiáng)大的基因到表型(Genotype-Phenotype)的分型系統(tǒng)來精確表征細(xì)胞、器官、組織和群體在不同發(fā)育階段和不同環(huán)境中表型組差異的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。近幾年來,這種交叉研究方法正被越來越多的頂尖生物團(tuán)隊?wèi)?yīng)用于各類植物研究中。在本次報告中,報告人將結(jié)合英國諾維奇科學(xué)研究院和南京農(nóng)業(yè)大學(xué)作物表型組學(xué)研究中心所開展的多尺度植物表型組研究,介紹植物表型采集平臺及相應(yīng)的高通量表型分析方法。包括如何實現(xiàn)從高空、田間、溫室到細(xì)胞層面等不同空間尺度開展植物表型的性狀獲取。在報告中,報告人將著重介紹AirSurf(自動航空圖像分析平臺)和CropQuant(分布式田間作物監(jiān)測系統(tǒng))在智慧農(nóng)業(yè)和小麥育種中的應(yīng)用。基于正在開展的中英研究項目,報告人將討論如何整合物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)、分布式計算、嵌入式人工智能和大數(shù)據(jù)管理等技術(shù)手段(如CropSight和SeedGerm),為植物研究提供可靠的表型組學(xué)分析平臺。同時,在結(jié)合具體生物學(xué)問題的基礎(chǔ)上,講解如何整合植物生長、氣候模式和表型特征等信息,量化基因型與環(huán)境互作(GxE)以及針對產(chǎn)量、質(zhì)量等動態(tài)性狀的提取分析。由于表型組學(xué)遠(yuǎn)未完善,報告中也將討論如何合理使用新的技術(shù)手段,以期為我國未來的植物研究產(chǎn)生積極影響。
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